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基因组组装航海日志

从转录本、蛋白质到长读长,不同证据解决不同层次的断裂。方法页说明适用范围,不提供旧软件二进制文件。

L_RNA_scaffolder

长转录本可以跨过被拆开的编码区域,为 scaffold 连接提供线索。

PEP_scaffolder

同源蛋白适合恢复基因区域,不能覆盖整个非编码基因组。

LR_Gapcloser

长读长跨越 gap 边界并填入序列,结果仍需检查错组装。

评估

N50、完整基因、错误连接、版本与独立证据要共同阅读。

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可以前往研究航海志,从具体设备、物种或组装问题继续。