一个沿坐标浏览基因组轨道，一个按序列相似性寻找候选；它们可以互相衔接，却不能替代彼此。
JBrowse从位置出发
基因组浏览器以染色体或 scaffold 坐标组织基因、转录本、重复、变异和覆盖轨道。用户知道目标区域时，可以查看附近结构和不同资料层。
轨道必须对应同一组装版本。若基因注释与参考序列错版，界面仍可能显示，却会把特征放在错误位置。
BLAST从一段序列出发
BLAST 比较查询序列与数据库，返回局部相似片段、得分、覆盖和期望值。它适合寻找同源候选、检查序列来源或定位未知片段。
高相似不自动等于功能相同，短序列、低复杂度和大型基因家族都需要更谨慎解释。
两种工具怎样连成工作流
研究者可以先用 BLAST 找到候选位置，再在 JBrowse 查看基因结构、相邻基因与其他轨道；也可以从浏览器选取区域，导出序列后进行相似搜索。
这种衔接依赖稳定标识符、版本和可引用 URL。
旧工具下线后该保留什么
无法恢复原始数据时，不应搭建假的搜索框和结果页面。更有价值的是保存工具职责、输入输出、版本关系与历史路径说明。
新站承接方法知识，不提供原 Fishbrowser 的实时 JBrowse 或 BLAST 服务。